化肥和农药为提高农作物的产量和质量、解决人类的粮食问题做出了不可磨灭的贡贡献，两者都是体现化学在农业生产中广泛应用的典型实例。化学肥料为农作物生长提供所需的某种（或几种）元素，目前人为地向土壤添加有所需元素的化学物质仍然是解决地力贫瘠的主要途径，农业生产的需要促进了肥料工业业的发展。农业上化肥的过量施用和水土流失，加上日常生活中含磷洗涤剂的使用，会造成近海和湖泊中的水体富营养化。水体中植物营养素的增加使藻类和其他浮游生物大量繁殖，使水中溶解氧急剧减少，导致鱼类大量死亡，产生“赤潮”或“永华”现象。农药的大量使用，一方面也会造成水体污染，另一方面会通过食物链危害人体健康。
